日前,華大智造為汕頭市、揭陽市及潮州市粵東三地疾控開放了ATOPlex DENV1-4靶向測序流程的先行先試,助力完成了登革病毒的三地聯(lián)合溯源研究。華大智造為此次聯(lián)合溯源研究提供了自主研發(fā)的全流程工具,不僅推動了粵東區(qū)域公共衛(wèi)生防護(hù)網(wǎng)的進(jìn)一步構(gòu)建,也積累了可借鑒、可推廣的經(jīng)驗(yàn)和模式。

登革熱是一種由登革病毒引起的蟲媒傳染病,感染的伊蚊為主要的傳播媒介。隨著全球貿(mào)易發(fā)展和旅游業(yè)的逐步復(fù)蘇,人口的流動加劇了登革熱疫情傳播的風(fēng)險(xiǎn)。在我國,每年的6~10月會進(jìn)入登革熱的易發(fā)季節(jié)。廣東地區(qū)的氣候適宜白紋伊蚊的生長,地區(qū)經(jīng)濟(jì)發(fā)達(dá),人口密度較大,因而廣東省各地對登革熱傳播的防控工作高度重視。今年8月份以來,廣東省內(nèi)各地疾控單位相繼調(diào)整對登革熱的防控等級,并發(fā)布公告,提醒廣大群眾注意防蚊滅蚊。

華大智造基于自主研發(fā)的ATOPlex多重PCR擴(kuò)增技術(shù)平臺,開發(fā)了針對登革病毒的樣本到報(bào)告的全流程產(chǎn)品組合,能夠覆蓋DENV1-DENV4四種血清型,支持檢測血清、環(huán)境等多種樣本;自主開發(fā)的軟件分析流程包含了變異檢測以及株系分型等功能模塊,為科研工作者和公衛(wèi)防控工作者提供了強(qiáng)有力的工具支撐。

華大智造ATOPlex DENV1-4靶向擴(kuò)增建庫試劑盒

01助力首家先行先試

華大智造&汕頭疾控“分子生物學(xué)前沿技術(shù)粵東區(qū)域培訓(xùn)基地”(以下簡稱“粵東培訓(xùn)基地”)今年5月在汕頭市正式揭牌成立,旨在共同促進(jìn)粵東區(qū)域生物安全體系建設(shè),推動病原檢測技術(shù)培養(yǎng)方案落地。為了提升登革熱防控能力,華大智造為粵東培訓(xùn)基地提供了可實(shí)現(xiàn)登革病毒快速鑒定及溯源的ATOPlex  DENV1-4靶向測序流程。9月中旬,汕頭市疾控中心在粵東培訓(xùn)基地基于MGISEQ-200平臺對10例感染病例樣本進(jìn)行ATOPlex DENV1-4靶向測序,經(jīng)后續(xù)分析均獲得了高質(zhì)量的基因組和準(zhǔn)確的鑒定分型,其中9例鑒定為DENV-1型,1例樣本為DENV-2型。

汕頭疾控工作人員基于華大智造設(shè)備操作登革病毒溯源

02輻射粵東聯(lián)合溯源

為了對粵東地區(qū)登革熱感染病例進(jìn)行更全面的溯源研究,在汕頭疾控之后,揭陽市和潮州市的疾控中心也立即響應(yīng),先后在基于MGISEQ-200平臺的ATOPlex DENV1-4靶向測序流程上完成測序。10月19日,潮州疾控完成8例登革熱感染病例樣本的測序及分析,分析報(bào)告顯示6例鑒定為2型,2例為1型,同時與潮州疾控自主完成的多平臺測序結(jié)果做比對,得到的結(jié)果均一致,且智造方案包含的分析報(bào)告能夠直觀地顯示樣本的變異、測序整體覆蓋度、病毒的相對定量濃度等信息。10月31日,揭陽疾控完成8例登革熱感染病例樣本的測序及分析,8例均為2型。三市病例樣本的鑒定結(jié)果說明,粵東三地該輪出現(xiàn)的登革熱感染病例可能為不同來源。此次粵東三地針對登革熱感染病例的聯(lián)合溯源研究,為公衛(wèi)防控研究人員進(jìn)一步判斷傳播模式提供了依據(jù),幫助疾控中心迅速響應(yīng)并展開對蚊媒的監(jiān)控和撲滅行動。

潮州疾控工作人員基于華大智造設(shè)備操作登革病毒溯源

揭陽疾控工作人員基于華大智造設(shè)備操作登革病毒溯源

汕頭-揭陽-潮州三市形成粵東公共衛(wèi)生防護(hù)網(wǎng)

03持續(xù)發(fā)力助力公衛(wèi)防控

華大智造自主研發(fā)的ATOPlex多重PCR建庫試劑盒定制化平臺,能夠在一管中實(shí)現(xiàn)超高重?cái)U(kuò)增,適用于多種痕量樣本的檢測,其具有靈敏度高,能夠相對定量等優(yōu)勢,在病原微生物捕獲測序中有廣泛的應(yīng)用。華大智造還將陸續(xù)推出針對結(jié)核分枝桿菌、HIV的ATOPlex建庫產(chǎn)品,不斷拓展DNBSEQ測序技術(shù)在病原微生物研究和傳染病防控領(lǐng)域的應(yīng)用場景。

在公共衛(wèi)生領(lǐng)域,華大智造已形成病原微生物宏基因組測序、靶向測序、全基因組測序等應(yīng)用場景的全流程產(chǎn)品組合。未來,秉承“創(chuàng)新智造引領(lǐng)生命科技”的理念,華大智造將持續(xù)研發(fā)創(chuàng)新,為公共衛(wèi)生事件的監(jiān)測和預(yù)警提供更自動、更便捷、更高效的自主核心工具。

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